聚合硫酸鐵經常作為水處理混凝劑，在處理污水時，能夠很快并且有效的去除大部分的有機物和懸浮物，其脫色效果更是要優于其他混凝劑，但在處理某些難降解廢水如印染廢水與制藥廢水時，在使用海泉聚合硫酸鐵投加后廢水會迅速變黑，從沉淀池到厭氧出水聚合硫酸鐵投加使廢水發黑全是黑的。
印染廢水常采用硫酸亞鐵進行脫色有時也會出現廢水發黑的情況，廢水中如果含有硫化物則會在混凝過程中與硫酸亞鐵形成硫化亞鐵，與聚合硫酸鐵形成硫化鐵，因為硫化鐵呈黑色，而其沉淀物礬花粒徑細又重力不夠無法迅速下沉，導致廢水呈現出大量硫化鐵礬花呈黑色。
對于發黑物質硫化鐵的處理方法，由于硫化鐵礬花沒有沉淀的原因是因為其重量輕無法沉淀，所以可以加入一定量的絮凝劑如聚丙烯酰胺等，對其進行強化快速絮凝粘結成團，促使其迅速沉降下去，從而達到去除黑色的目的。
其次可通過在廢水先投加石灰對硫化物進行去除后，再投加聚合硫酸鐵進行混凝處理，這樣便不會產生硫化鐵。如是采用海泉硫酸亞鐵混凝的話，則可加大曝氣量，防止其缺氧。或者不用曝氣，加大水力攪拌，防止亞鐵離子氧化成三價鐵離子再反應生成黑色硫化鐵。
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